面向低丰度蛋白质翻译后修饰，连接位点注释、证据检索与结合蛋白设计。
让每一个值得探索的修饰，都有通往精准识别的路径。
| 统计项目 | NON-REDUNDANT非冗余 | TOTAL总数 |
|---|---|---|
| 蛋白质Proteins | 20,495 | 60,360 |
| 全部修饰位点PTMs, all types | 495,384 | 614,540 |
| 低通量方法支持的修饰位点PTMs, low-throughput (LTP) methods | 26,649 | 33,051 |
| 高通量 MS/MS 支持的修饰位点PTMs, high-throughput (HTP) MS/MS | 487,747 | 602,091 |
| 质谱肽段MS peptides | 785,943 | 3,217,813 |
| 整理文献Number curated papers | — | 33,615 |
条形长度以所列最大类别为基准；参考快照不代表当前可检索数据量。
| 修饰类别 | 非冗余位点 |
|---|---|
| Phospho-Ser | 181,199 |
| Ubiquitylation | 111,602 |
| Phospho-Thr | 73,966 |
| Phospho-Tyr | 45,229 |
| Acetylation | 39,969 |
| Mono-Methylation | 15,239 |
| Sumoylation | 8,742 |
| N-Glycosylation | 6,401 |
| Succinylation | 5,434 |
| Di-Methylation | 2,940 |
| O-Galnac | 2,112 |
| O-Glcnac | 1,786 |
| Caspase cleavage | 484 |
| Methylation | 391 |
| Tri-Methylation | 358 |
类别合计 495,852，与快照报告的全部修饰位点 495,384 相差 468；保留原始统计口径。当前导入数据请查看下方完整修饰统计。
按来源记录计数，共 16 类；占比基数为 616,197 条，非去重位点组数。
| 修饰 | 类别名称 | 来源记录数 | 数量分布 / 全库占比 | 操作 |
|---|---|---|---|---|
| pS | 丝氨酸磷酸化 | 239,712 | 38.90% | |
| Ub | 泛素化 | 126,329 | 20.50% | |
| pT | 苏氨酸磷酸化 | 85,336 | 13.85% | |
| pY | 酪氨酸磷酸化 | 53,873 | 8.74% | |
| Ac | 乙酰化 | 48,543 | 7.88% | |
| Me1 | 单甲基化 | 16,611 | 2.70% | |
| pArg | 精氨酸磷酸化 | 11,182 | 1.81% | |
| pLys | 赖氨酸磷酸化 | 10,762 | 1.75% | |
| SUMO | SUMO 化 | 8,982 | 1.46% | |
| pHis | 组氨酸磷酸化 | 6,718 | 1.09% | |
| Me2 | 二甲基化 | 3,388 | 0.55% | |
| O-GalNAc | O-GalNAc 糖基化 | 2,115 | 0.34% | |
| O-GlcNAc | O-GlcNAc 糖基化 | 1,871 | 0.30% | |
| Me3 | 三甲基化 | 399 | 0.06% | |
| Me | 甲基化（未细分） | 359 | 0.06% | |
| pOther | 其他残基磷酸化（原始注释） | 17 | 0.00% |
全部 16 类 · 合计 616,197 条
统一检索修饰位点、功能证据与变异注释，保留每一条记录的来源。
按蛋白、位点、物种与来源检索，再将真实序列上下文载入设计。
| 蛋白 / Accession | 位点 | 修饰类型 | 物种 | 来源 / 证据计数 | 操作 |
|---|
来源记录按文件行保留；相同位点可有多条记录。LTP / MS 为源文件计数，不是模型评分。物种名称统一后检索，菌株与蛋白异构体不强行合并。
按原始文件行浏览，不将同源位点组误当作同一蛋白的实验结果。
定义靶标、配置选择性约束，生成可交接的设计任务。
管理本浏览器保存的任务草稿，不代表任何后台计算已启动。
本地任务状态始终为 DRAFT。连接任务 API、计算队列与 PTM-aware 后端，并通过输入校验后，才可转为已提交或运行状态。
保留序列、位点、对照、版本与来源；错误状态不可覆盖为计算成功。
可复现导入、来源许可说明与真实后端接口。
ModiBind 提供修饰位点查询、证据与变异浏览、数据导出及 Binder 设计任务配置。以下说明帮助您完成从位点检索到任务整理的主要操作。
进入 PTM数据库后输入基因名称、蛋白名称、UniProt accession 或位点关键词，例如 TP53、P04637 或 pArg。可结合物种、修饰类型、数据类别和证据条件缩小范围，再通过排序和分页浏览结果。点击记录中的“详情”查看完整信息。
位点详情展示蛋白标识、物种、残基位置、修饰类型、序列窗口及可用的蛋白全长序列。关联证据包括激酶–底物、功能调控、疾病关联和 PTM 相关变异注释，也可在“证据与变异”页签中独立检索。文献计数、实验标记与定位提示应结合原始文献理解。
校园网版本通过本机数据库服务按需查询，无需在浏览器中下载完整数据库。页面顶部显示“全量数据 · 服务模式”后即可查询；若无法连接，请确认网站主机保持开机并连接校园网。
在位点结果列表中点击“导出 CSV”，可导出当前筛选条件下的记录；勾选记录后，导出范围为所选记录。位点详情支持 JSON 导出，包含关联注释；“证据与变异”页签可导出当前筛选结果。导出文件保留记录标识、坐标和溯源字段，便于后续分析。
在位点详情中点击“用于 Binder 设计”，按步骤确认靶标、识别位点、骨架和设计约束。系统根据序列与位点的匹配情况载入全长序列或局部窗口，并保留蛋白原始坐标与设计输入坐标。配置完成后可保存任务草稿或导出 JSON 参数文件。当前输出为设计任务配置；候选生成、结构预测和评分需由计算流程执行。
保存后的任务可在“任务工作台”中查看、导出或删除。草稿保存在当前设备的浏览器中，状态为 DRAFT；保存操作本身不提交计算。切换设备、使用隐私浏览或清除浏览器站点数据可能导致无法访问原有草稿，建议及时导出重要任务。
网站按数据快照中的来源记录统计规模，同一生物学位点可能对应多条记录。来源记录数、独立位点键、蛋白条目和位点组采用不同统计口径。当前筛选结果的数量会随条件变化；完整统计定义和序列质量说明可在“资源与文档 → 数据与来源”中查阅。
可检索位点与研究注释分表存储，关系按精确来源字段建立。
| 字段 | 说明 |
|---|---|
| id | 本次导入的稳定行编号；不是 UniProt accession。 |
| uniprot_accession / species | 精确 accession 与标准化物种。菌株和异构体不合并。 |
| site / residue / type | 蛋白来源坐标（1-based）、残基与修饰类型。 |
| site_group_id | 同源/异构体位点组标识，不替代精确蛋白位点。 |
| context | 来源 ±7 aa 窗口，保留大小写和终端填充下划线。 |
| lt_lit / ms_lit / ms_cst | 来源计数；空白索引为 0，字段之间可能重叠。 |
| ambiguous_site | 源文件定位歧义标记，原值保留，不能视为高置信度。 |
| source_file / source_line | 用户上传原始文件及行号。 |
| source_protein_position / coordinate_offset | Binder 导出中的蛋白坐标及输入窗口偏移。 |
| is_demo | 当前导入条目均为 false；表示不是合成演示记录，不代表独立实验复核。 |
服务模式使用只读 SQLite 数据 API；设计任务仅保存到当前浏览器，不上传用户序列。
/api/summary统计与字段字典/api/sites?q=TP53&page=1真实位点检索与分页/api/sites/{id}序列与精确匹配注释/api/annotations?kind=kinase四类证据检索/api/export?q=TP53完整筛选结果 CSV/api/visits累计页面访问量/api/visits页面访问幂等计数保留原始 raw.zip，在源码目录执行 python build_data.py /path/to/raw.zip 后，再执行 python build_release.py 更新浏览器包。来源清单包含 SHA-256，避免重复导入 TGZ 数据。完整重建步骤见 README。
全部指标从 raw.zip 实际解析；区分来源记录、独立位点键和位点组。
| 统计项目 | 实际数值 | 统计口径 |
|---|---|---|
| 多类型修饰记录 | 587,568 | 7 个主位点文件的数据行 |
| N-磷酸化记录 | 28,629 | N-磷酸化位点表的数据行 |
| 来源记录合计 | 616,197 | 不重复导入 TGZ 中的同名文件 |
| 独立位点键 | 616,136 | Accession + 物种 + 残基/位置 + 修饰类型 |
| 位点组 | 473,432 | 仅对本次 7 个主文件的 SITE_GRP_ID 去重 |
| 含位点蛋白条目 | 56,143 | Accession + 标准化物种组合 |
| FASTA 原始记录 | 63,029 | 去重前的输入 FASTA 记录数 |
| 可用非空 FASTA 条目 | 63,010 | 按 Accession + 物种建立索引 |
43 条来源内部重复位点键保留为独立行；跨来源重合 18 个位点键，未抹去各自证据。
异常记录不删除、不自动改写。设计时优先使用与来源窗口一致的全长序列，否则使用局部窗口并显式导出两套坐标。
FASTA 中另发现 2 条同键冲突序列，已列入导入报告。历史源数据不等于当前数据库版本。
原表与本次文件快照日期及统计定义不一致，不强行对齐。15 类合计 495,852，与原总表 495,384 相差 468，原值保持不变。
| 原始站点统计 | NON-REDUNDANT | TOTAL |
|---|---|---|
| Proteins | 20,495 | 60,360 |
| PTMs, all types | 495,384 | 614,540 |
| PTMs, LTP | 26,649 | 33,051 |
| PTMs, HTP MS/MS | 487,747 | 602,091 |
| MS peptides | 785,943 | 3,217,813 |
| Number curated papers | 未提供 | 33,615 |
| 原始修饰统计 | NON-REDUNDANT |
|---|---|
| Acetylation | 39,969 |
| Caspase cleavage | 484 |
| Di-Methylation | 2,940 |
| Methylation | 391 |
| Mono-Methylation | 15,239 |
| N-Glycosylation | 6,401 |
| O-Galnac | 2,112 |
| O-Glcnac | 1,786 |
| Phospho-Ser | 181,199 |
| Phospho-Thr | 73,966 |
| Phospho-Tyr | 45,229 |
| Succinylation | 5,434 |
| Sumoylation | 8,742 |
| Tri-Methylation | 358 |
| Ubiquitylation | 111,602 |